| MEDI Bioinformatik II | SG | INF | |
|---|---|---|---|
| Dozent : |
Prof. Dr. rer. nat. habil. Jörg Richard Weimar eMail | Homepage |
Semester | 5 |
| Einordnung : | Medizininformatik, Wahlpflicht Katalog B-MED-INF | SWS | 4 |
| Sprache : | Deutsch | Art | V Ü |
| Prüfungsart : | PL | Credits | 5 |
| Prüfungsform : | Klausur 90 min | ||
| Voraussetzungen : | |||
| Querverweise : | Hinweise zur Lehrveranstaltung | ||
| Vorkenntnisse : | Grundlagen der Informatik, Bioinformatik I | ||
| Hilfsmittel und Besonderheiten : | Studien- und Prüfungsleistungen: Abschlussklausur / mündliche Prüfung mit Übungsvoraussetzungen Die Note entspricht der Note der Abschlussklausur / mündliche Prüfung | ||
| Lehrziele : | Die Studierenden kennen den prinzipiellen Aufbau von Proteinen und DNA/RNA, kennen die Visualisierungstechniken. Sie wissen, wie 3D Strukturinformationen gewonnen werden und können solche Daten aus öffentlichen Datenbanken finden und visualisieren. Sie kennen die Methoden der Strukturvorhersage, können deren Zuverlässigkeit einschätzen und sie praktisch anwenden. Sie kennen die Grundlagen von Kraftfeldern und der molekulardynamischen Simulation. Sie können solche Simulationen praktisch durchführen. Sie können Proteinstrukturen vergleichen, kennen die Vergleichsmaße und die Transformationen, die zum Vergleich nötig sind. | ||
| Lehrinhalte : | In der Bioinformatik werden Algorithmen, Datenstruk-turen und Methoden der Informatik auf Probleme der molekularen Biologie angewendet. In der Vorlesung Bioinformatik II beschäftigen wir uns mit 3-D Strukturen von biologischen Makromolekülen, im wesentlichen von Proteinen. Es werden Algorithmen und Verfahren vorgestellt, solche Strukturen zu ermitteln, zu vergleichen, vorherzusagen, zu visualisieren, und zu simulieren. | ||
| Literatur : | Bourne und Weissig: Structural Bioinformatics A. R. Leach: Molecular Modelling, priciples and applications | ||