1Die klassische Bioinformatik beschäftigt sich mit der Speicherung, Verarbeitung und Analyse von DNA- und Aminosäuresequenzen. In dieser Vorlesung werden die grundlegenden Algorithmen und Programme hierzu vorgestellt: Exakte Textsuche, Scoring und Alignment, dynamische Programmierung, heuristische Verfahren (BLAST,dots), multiple Alignments, HMMs, RNA-Faltung, Genom-Assemblierung und Vergleich. Weiter werden die molekularbiologischen Datenbanken vorgestellt, die Datenorganisation diskutiert, und die Integration von Datenbanken (SRS, Protonet, ...).